در مافیا پدرخوانده 3، سناریو شرلوک هلمز، شهروندان و مافیا علاوه بر غلبه و فریب یکدیگر باید مراقب باشند که شرلوک هلمز از این موقعیت برای پیروزی خود بهره نبرد.